MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Enterococcus faecalis D32 plasmid EFD32pA

Total Repeats: 288

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018222	TGT	2	6	15	20	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698493
2	NC_018222	CTCA	2	8	78	85	25 %	25 %	0 %	50 %	397698493
3	NC_018222	CTT	2	6	309	314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397698493
4	NC_018222	CA	3	6	331	336	50 %	0 %	0 %	50 %	397698493
5	NC_018222	AAG	2	6	341	346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
6	NC_018222	AAC	2	6	369	374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698493
7	NC_018222	CTA	2	6	398	403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397698493
8	NC_018222	AGC	2	6	495	500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397698493
9	NC_018222	AAT	2	6	504	509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698493
10	NC_018222	T	6	6	610	615	0 %	100 %	0 %	0 %	397698493
11	NC_018222	CAAA	2	8	663	670	75 %	0 %	0 %	25 %	397698493
12	NC_018222	ATA	2	6	674	679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698493
13	NC_018222	A	6	6	727	732	100 %	0 %	0 %	0 %	397698493
14	NC_018222	TTA	2	6	760	765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698493
15	NC_018222	ACGAA	2	10	767	776	60 %	0 %	20 %	20 %	397698493
16	NC_018222	TAG	2	6	797	802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698493
17	NC_018222	CT	4	8	824	831	0 %	50 %	0 %	50 %	397698493
18	NC_018222	AATAT	2	10	872	881	60 %	40 %	0 %	0 %	397698493
19	NC_018222	TAA	2	6	891	896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698493
20	NC_018222	AGA	2	6	915	920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
21	NC_018222	AAG	2	6	923	928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
22	NC_018222	ATTT	2	8	1037	1044	25 %	75 %	0 %	0 %	397698493
23	NC_018222	GGT	2	6	1055	1060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698493
24	NC_018222	A	7	7	1072	1078	100 %	0 %	0 %	0 %	397698493
25	NC_018222	AGA	2	6	1116	1121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
26	NC_018222	A	6	6	1142	1147	100 %	0 %	0 %	0 %	397698493
27	NC_018222	CGA	2	6	1172	1177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397698493
28	NC_018222	A	6	6	1180	1185	100 %	0 %	0 %	0 %	397698493
29	NC_018222	GAA	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
30	NC_018222	TGG	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698493
31	NC_018222	TTG	2	6	1321	1326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698493
32	NC_018222	A	6	6	1345	1350	100 %	0 %	0 %	0 %	397698493
33	NC_018222	GAA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
34	NC_018222	TA	3	6	1366	1371	50 %	50 %	0 %	0 %	397698493
35	NC_018222	TTTG	2	8	1467	1474	0 %	75 %	25 %	0 %	397698493
36	NC_018222	GTTT	2	8	1537	1544	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018222	GTG	2	6	1551	1556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018222	TGAT	2	8	1562	1569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018222	TATT	2	8	1596	1603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018222	GAAGC	2	10	1693	1702	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018222	AATTT	2	10	1720	1729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018222	T	6	6	1727	1732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018222	AAT	2	6	1756	1761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018222	ATT	2	6	1778	1783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018222	TATT	2	8	1818	1825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018222	AAGT	2	8	1836	1843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018222	TAA	2	6	1907	1912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018222	ATT	2	6	1917	1922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018222	TG	3	6	1993	1998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018222	GTA	2	6	2050	2055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018222	A	7	7	2120	2126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018222	ATA	2	6	2254	2259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018222	GGA	2	6	2260	2265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018222	A	6	6	2274	2279	100 %	0 %	0 %	0 %	397698494
55	NC_018222	TTTA	2	8	2280	2287	25 %	75 %	0 %	0 %	397698494
56	NC_018222	GTG	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698494
57	NC_018222	CAA	2	6	2331	2336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698494
58	NC_018222	TTGAAA	2	12	2386	2397	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397698494
59	NC_018222	GA	3	6	2429	2434	50 %	0 %	50 %	0 %	397698494
60	NC_018222	GGTT	2	8	2443	2450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018222	AGAAC	2	10	2490	2499	60 %	0 %	20 %	20 %	397698495
62	NC_018222	ATTGTT	2	12	2620	2631	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397698495
63	NC_018222	ATA	2	6	2657	2662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698495
64	NC_018222	TGA	2	6	2678	2683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698495
65	NC_018222	TCAAAT	2	12	2685	2696	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397698495
66	NC_018222	AATG	2	8	2733	2740	50 %	25 %	25 %	0 %	397698495
67	NC_018222	A	8	8	2820	2827	100 %	0 %	0 %	0 %	397698495
68	NC_018222	A	6	6	2866	2871	100 %	0 %	0 %	0 %	397698495
69	NC_018222	GTC	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397698495
70	NC_018222	GAA	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698495
71	NC_018222	AATC	2	8	2985	2992	50 %	25 %	0 %	25 %	397698495
72	NC_018222	A	6	6	3045	3050	100 %	0 %	0 %	0 %	397698495
73	NC_018222	A	6	6	3144	3149	100 %	0 %	0 %	0 %	397698496
74	NC_018222	TTG	2	6	3346	3351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698496
75	NC_018222	ATT	2	6	3378	3383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
76	NC_018222	GAAT	2	8	3538	3545	50 %	25 %	25 %	0 %	397698496
77	NC_018222	AAG	2	6	3562	3567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
78	NC_018222	ACA	2	6	3635	3640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
79	NC_018222	A	6	6	3732	3737	100 %	0 %	0 %	0 %	397698496
80	NC_018222	T	6	6	3743	3748	0 %	100 %	0 %	0 %	397698496
81	NC_018222	CA	3	6	3806	3811	50 %	0 %	0 %	50 %	397698496
82	NC_018222	TCT	2	6	3849	3854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397698496
83	NC_018222	AGA	2	6	3910	3915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
84	NC_018222	GTTT	2	8	3931	3938	0 %	75 %	25 %	0 %	397698496
85	NC_018222	AGT	2	6	3945	3950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698496
86	NC_018222	ATT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
87	NC_018222	TTA	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
88	NC_018222	T	6	6	4118	4123	0 %	100 %	0 %	0 %	397698496
89	NC_018222	GTA	2	6	4177	4182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698496
90	NC_018222	CAA	2	6	4210	4215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
91	NC_018222	TACC	2	8	4222	4229	25 %	25 %	0 %	50 %	397698496
92	NC_018222	GAA	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
93	NC_018222	ATCG	2	8	4370	4377	25 %	25 %	25 %	25 %	397698496
94	NC_018222	AAG	2	6	4393	4398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
95	NC_018222	ACA	2	6	4418	4423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
96	NC_018222	AGA	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
97	NC_018222	ATT	2	6	4547	4552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
98	NC_018222	TGA	3	9	4583	4591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698496
99	NC_018222	AAG	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
100	NC_018222	TAT	2	6	4652	4657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
101	NC_018222	AT	3	6	4679	4684	50 %	50 %	0 %	0 %	397698496
102	NC_018222	TTG	2	6	4705	4710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698496
103	NC_018222	ATT	2	6	4727	4732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
104	NC_018222	A	8	8	4802	4809	100 %	0 %	0 %	0 %	397698496
105	NC_018222	TTA	2	6	4840	4845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
106	NC_018222	A	6	6	4854	4859	100 %	0 %	0 %	0 %	397698496
107	NC_018222	AGAA	2	8	4930	4937	75 %	0 %	25 %	0 %	397698496
108	NC_018222	AAG	2	6	4939	4944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
109	NC_018222	A	6	6	4948	4953	100 %	0 %	0 %	0 %	397698496
110	NC_018222	CAA	2	6	4982	4987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
111	NC_018222	A	7	7	4997	5003	100 %	0 %	0 %	0 %	397698496
112	NC_018222	GTT	2	6	5014	5019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698496
113	NC_018222	AGAA	2	8	5061	5068	75 %	0 %	25 %	0 %	397698496
114	NC_018222	A	6	6	5067	5072	100 %	0 %	0 %	0 %	397698496
115	NC_018222	AT	3	6	5186	5191	50 %	50 %	0 %	0 %	397698496
116	NC_018222	TA	3	6	5244	5249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018222	TTG	2	6	5292	5297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018222	ATAAGA	2	12	5306	5317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018222	AGAA	2	8	5324	5331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018222	GTGA	2	8	5332	5339	25 %	25 %	50 %	0 %	397698497
121	NC_018222	A	7	7	5395	5401	100 %	0 %	0 %	0 %	397698497
122	NC_018222	GTTCGT	2	12	5423	5434	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	397698497
123	NC_018222	AAG	2	6	5490	5495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698497
124	NC_018222	GT	3	6	5529	5534	0 %	50 %	50 %	0 %	397698497
125	NC_018222	AAG	2	6	5608	5613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018222	ATAA	2	8	5702	5709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018222	ACAA	2	8	5773	5780	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018222	TATT	2	8	5796	5803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018222	ATA	2	6	5894	5899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698498
130	NC_018222	ACG	2	6	5963	5968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397698498
131	NC_018222	AACA	2	8	6104	6111	75 %	0 %	0 %	25 %	397698498
132	NC_018222	TTG	2	6	6123	6128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698498
133	NC_018222	CA	3	6	6151	6156	50 %	0 %	0 %	50 %	397698498
134	NC_018222	ATT	2	6	6158	6163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698498
135	NC_018222	A	6	6	6164	6169	100 %	0 %	0 %	0 %	397698498
136	NC_018222	ATCT	2	8	6197	6204	25 %	50 %	0 %	25 %	397698498
137	NC_018222	TTG	2	6	6207	6212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698498
138	NC_018222	AAG	2	6	6213	6218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698498
139	NC_018222	TAA	2	6	6348	6353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698498
140	NC_018222	TA	3	6	6399	6404	50 %	50 %	0 %	0 %	397698498
141	NC_018222	TCA	2	6	6466	6471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397698498
142	NC_018222	TAT	2	6	6549	6554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698498
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147	NC_018222	TAC	2	6	6643	6648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_018222	GTT	2	6	6799	6804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_018222	T	8	8	12529	12536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_018222	AT	3	6	12566	12571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_018222	ACCA	2	8	12619	12626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
279	NC_018222	TAT	2	6	12713	12718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_018222	TAG	2	6	12738	12743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_018222	TTA	2	6	12752	12757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_018222	GAA	2	6	12771	12776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_018222	TAG	2	6	12785	12790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_018222	ATCA	2	8	12799	12806	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
286	NC_018222	TGAT	2	8	12814	12821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
287	NC_018222	T	6	6	12825	12830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_018222	T	6	6	12867	12872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.